Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms