Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms