Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms