Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nedd1P33215 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms