Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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