Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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