Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CftrP26361 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CftrP26361 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CftrP26361 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CftrP26361 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CftrP26361 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CftrP26361 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CftrP26361 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CftrP26361 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CftrP26361 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CftrP26361 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CftrP26361 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CftrP26361 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CftrP26361 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CftrP26361 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CftrP26361 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CftrP26361 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CftrP26361 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CftrP26361 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CftrP26361 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CftrP26361 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms