Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf239P24399 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms