Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms