Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms