Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmnb2P21619 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb2P21619 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb2P21619 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb2P21619 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb2P21619 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb2P21619 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb2P21619 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb2P21619 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb2P21619 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb2P21619 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms