Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a2P20490 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms