Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms