Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms