Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ass1P16460 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms