Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nr4a1P12813 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nr4a1P12813 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms