Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms