Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PolP10400 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PolP10400 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PolP10400 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PolP10400 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PolP10400 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PolP10400 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PolP10400 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PolP10400 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PolP10400 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PolP10400 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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