Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb8P09632 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms