Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms