Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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