Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-Eb1P04230 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-Eb1P04230 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H2-Eb1P04230 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H2-Eb1P04230 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H2-Eb1P04230 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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