Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lamc1P02468 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamc1P02468 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms