Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnkO88874 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnkO88874 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnkO88874 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms