Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ShdO88834 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ShdO88834 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ShdO88834 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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