Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nme6O88425 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nme6O88425 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms