Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkbO55229 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkbO55229 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms