Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc4O35988 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Sdc4O35988 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sdc4O35988 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sdc4O35988 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sdc4O35988 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sdc4O35988 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sdc4O35988 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sdc4O35988 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc4O35988 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdc4O35988 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdc4O35988 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdc4O35988 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sdc4O35988 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Sdc4O35988 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Sdc4O35988 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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