Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf9O35739 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms