Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms