Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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