Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx2O08686 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms