Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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