Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
U90926O08546 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
U90926O08546 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
U90926O08546 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
U90926O08546 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
U90926O08546 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
U90926O08546 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
U90926O08546 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
U90926O08546 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
U90926O08546 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
U90926O08546 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
U90926O08546 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
U90926O08546 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
U90926O08546 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
U90926O08546 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms