Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm21972J3QN38 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm21972J3QN38 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm21972J3QN38 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21972J3QN38 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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