Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms