Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms