Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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