Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc146E9Q9F7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc146E9Q9F7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms