Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U0

Kcnmb3, Potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb3E9Q7U0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnmb3E9Q7U0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnmb3E9Q7U0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms