Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgbd1E9Q492 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms