Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms