Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3095E9Q058 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms