Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms