Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsf1E9PWW9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms