Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms