Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms