Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clrn2B2RVW2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clrn2B2RVW2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms