Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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