Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skint4A7TZF3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms